| отряд / порядок | Черепахи | Testudines | Batsch | 1788 |
| легион | Неопределенное положение | Incertae sedis | ||
| инфракласс | Архозавроморфы | Archosauromorpha | Huene | 1946 |
| подкласс | Диапсиды | Diapsida | Osborn | 1903 |
| класс | Пресмыкающиеся (Рептилии) | Reptilia | ||
| надкласс | Четвероногие | Tetrapoda | Broili | 1913 |
| подтип / подотдел | Позвоночные (Черепные) | Vertebrata (Craniata) | Cuvier | 1800 |
| тип / отдел | Хордовые | Chordata | ||
| надтип | Целомические животные | Coelomata | ||
| раздел | Двусторонне-симметричные (Трёхслойные) | Bilateria (Triploblastica) | ||
| надраздел | Эуметазои | Eumetazoa | ||
| подцарство | Многоклеточные животные | Metazoa | ||
| царство | Животные | Animalia | ||
| надцарство | Ядерные | Eukaryota | Chatton | 1925 |
| империя | Клеточные |
| подотряд / подпорядок | Скрытошейные черепахи | Cryptodira |
| подотряд / подпорядок | Морские черепахи | Chelonioidea |
| подотряд / подпорядок | Мягкотелые черепахи | Trionychoidea |
| подотряд / подпорядок | Бокошейные черепахи | Pleurodira | Cope | 1865 |
| подотряд / подпорядок | Бесщитковые черепахи | Athecae |
| подотряд / подпорядок | (Amphichelydia) | Amphichelydia |
| подотряд / подпорядок | (Eunotosauria) | Eunotosauria |
| подотряд / подпорядок | Проганохелисиды | Proganochelydia |
| подотряд / подпорядок | Неопределенное положение | Incertae sedis |